將無菌微孔濾膜放置于已滅菌的過濾系統支撐墊上，裝上已滅菌濾杯，倒進待檢測液體樣品，打開真空泵調至－0.5大氣壓，打開相應的濾杯閥門進行抽濾，此時樣品中所含的微生物被截留富集在濾膜上，然后將該濾膜貼于相應的培養基上進行恒溫培養，計數得出相應菌落。
注意事項
1、當供試品中含有不溶性的顆粒，懸浮物時，可能導致濾膜堵塞影響過濾，應將供試品進行預處理，除去顆粒或懸浮物；
2、儀器不工作時，請斷電；
3、抽濾前，應確保管道密封性良好；
4、根據供試品性狀來選擇濾膜材質，過濾前后應保證濾膜的完整性；
5、不能抽濾強酸、強堿、強氧化劑、強腐蝕等液體。